29. novembra 2017 bola ukončená 3. fáza reštaurovania Oltára sv. Petra a sv. Pavla (ev.č. S 2960), pochádzajúceho z neznámej spišskej lokality, ktorý do svojich zbierok získalo múzeum v prvej tretine 20.storočia. Išlo o reštaurovanie krídel oltára s bohatou ornamentálnou rezbou zlátených rozvilín a tabuľovými maľbami s výjavmi mučenia sv. Petra a sv. Pavla.
Projekt je pokračovaním v kompletnom zreštaurovaní vzácneho, umelecko-historicky jedinečného artefaktu vývoja umenia na území súčasného Slovenska, dokumentujúceho obdobie renesancie a baroka, a jeho prezentácia domácim i zahraničným návštevníkom v stálej expozícii Východoslovenského múzea – Storočia v umení.
Nakoľko ide o rozsiahle, časovo a finančne náročné zásahy je reštaurovanie celého Oltára sv. Petra a Pavla rozdelené na štyri etapy v časovom horizonte realizácie do roku 2018. Prvá etapa – reštaurovanie centrálneho obrazu Oltára Sv. Petra a Pavla, s finančným dotáciou MK SR bolo realizované v r. 2014. II. etapa - reštaurovanie tabuľovej maľby z nadstavca oltára s výjavom Panny Márie bola zrealizovaná v r. 2016 s podporou Fondu pre podporu umenia rovnako ako tretia etapa - reštaurovanie tabuľových malieb krídel v tomto roku. Štvrtá etapa – reštaurovanie architektúry oltára a predely s výjavom Poslednej večere je plánovaná na r. 2018, a tým by mal byť tento projekt ukončený.